應(yīng)該怎樣尋找基因啟動子區(qū)呢?？
u_110543517
2021-08-26 06:27
這個主要是通過計算機方法，有幾種選擇。作為一個規(guī)則，通過多種方法預(yù)測的外顯子提高了預(yù)測的正確率而不會出現(xiàn)“假陽性”結(jié)果。多數(shù)方法顯示3′端非翻譯區(qū)，以左側(cè)大而短的塊狀表示。Acembly路徑顯示除了全長序列產(chǎn)物（如這個部分第3條線所示）之外還有3個可能的選擇性剪接，其它大多數(shù)路徑顯示與此預(yù)測結(jié)果相符。Genscan路徑從左、右方向往遠處延伸：GENSCAN可以被用于預(yù)測多個基因。推薦一篇文章：http://wenku.baidu.com/view/78 ... .html
ty_135074791 2021-08-26 06:33
?啟動子是基因（gene）的一個組成部分，控制基因表達（轉(zhuǎn)錄）的起始時間和表達的程度。 基因啟動子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點的上游幾kb的區(qū)域內(nèi)，一般來說啟動子區(qū)域具有一定的保守序列特征，另外，啟動子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量，這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島；如果一個新的基因在不能確定其啟動子的情況下，最好在設(shè)計PCR引物時，多設(shè)計幾對，最大限度地將新基因的啟動子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
涼涼愛家喂 2021-08-26 06:35
啟動子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄，調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答，對基因的表達水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。
對于如何查找啟動子，現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用，而且ncbi上也可以應(yīng)用，所以是比較方便的。
國民男神林更新 2021-08-26 06:44
一般來說從數(shù)據(jù)庫找。像是NCBI之類的，網(wǎng)上有教程的，像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
這個主要是通過計算機方法，有幾種選擇。作為一個規(guī)則，通過多種方法預(yù)測的外顯子提高了預(yù)測的正確率而不會出現(xiàn)“假陽性”結(jié)果。多數(shù)方法顯示3′端非翻譯區(qū)，以左側(cè)大而短的塊狀表示。Acembly路徑顯示除了全長序列產(chǎn)物（如這個部分第3條線所示）之外還有3個可能的選擇性剪接，其它大多數(shù)路徑顯示與此預(yù)測結(jié)果相符。Genscan路徑從左、右方向往遠處延伸：GENSCAN可以被用于預(yù)測多個基因。推薦一篇文章：http://wenku.baidu.com/view/78 ... .html
ty_135074791 2021-08-26 06:33
?啟動子是基因（gene）的一個組成部分，控制基因表達（轉(zhuǎn)錄）的起始時間和表達的程度。 基因啟動子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點的上游幾kb的區(qū)域內(nèi)，一般來說啟動子區(qū)域具有一定的保守序列特征，另外，啟動子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量，這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島；如果一個新的基因在不能確定其啟動子的情況下，最好在設(shè)計PCR引物時，多設(shè)計幾對，最大限度地將新基因的啟動子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
涼涼愛家喂 2021-08-26 06:35
啟動子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄，調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答，對基因的表達水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。
對于如何查找啟動子，現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用，而且ncbi上也可以應(yīng)用，所以是比較方便的。
國民男神林更新 2021-08-26 06:44
一般來說從數(shù)據(jù)庫找。像是NCBI之類的，網(wǎng)上有教程的，像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
