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歸國(guó)科學(xué)家顏寧回應(yīng)研究方向正被AI取代|還停留在2017年的水平[AlphaFold]?

2017年,著名結(jié)構(gòu)生物<愛(ài)尬聊_頭條百科>學(xué)家顏寧離開任教10年的清華大學(xué),到美國(guó)普林斯頓大學(xué)就職,備受爭(zhēng)議。

最近,顏寧又毫無(wú)征兆地宣布選擇歸國(guó),出任深圳醫(yī)學(xué)科學(xué)院創(chuàng)始院長(zhǎng),再次引發(fā)熱議。

有一種聲音就提出,顏寧的主要研究方向,其實(shí)已經(jīng)被AI所取代,其工作失去了以往的價(jià)值。

對(duì)此,忙于工作、懶得辟謠的顏寧,還是在個(gè)人微博露面,作了一番科普,也談了自己的想法。

顏寧在回應(yīng)中特別提到了AlphaFold,Google公司旗下DeepMind團(tuán)隊(duì)出品的AI工具,與大名鼎鼎的圍棋AI AlphaGo師出同門,可以根據(jù)基因序列預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的3D形狀,而且準(zhǔn)確性驚人。

顏寧指出,去年8月8日就曾有一份論文,討論AlphaFold的局限性,而到了今天,這份報(bào)告仍然一張都不用改。

簡(jiǎn)單地說(shuō),顏寧專注的電壓門控鈉離子和鈣離子通道的幾個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題,包括electromechanical coupling、ion selection、MOA of drugs and toxins,AlphaFold在過(guò)去解析諸多結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,去年的預(yù)測(cè)達(dá)到了顏寧團(tuán)隊(duì)2017年的水平,今年依舊停留在這個(gè)水平(僅針對(duì)Nav/Cav)。

顏寧也在與專門做結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的AI團(tuán)隊(duì)合作,分別做預(yù)測(cè)和實(shí)驗(yàn),測(cè)試新型小分子與蛋白的相互作用。

結(jié)果呢?迄今為止,AI的預(yù)測(cè)無(wú)一正確。

顏寧對(duì)此解釋說(shuō),結(jié)構(gòu)生物學(xué)不僅僅是看到蛋白質(zhì)的折疊,更要理解蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)變化,要理解與其他生物大分子或者調(diào)節(jié)小分子的相互作用,要理解在細(xì)胞原位里的狀態(tài),這些都是AI目前尚無(wú)能為力的領(lǐng)域,因?yàn)樯袥](méi)有足夠的數(shù)據(jù)庫(kù)去訓(xùn)練它。

比如說(shuō),顏寧團(tuán)隊(duì)Cav2.2的結(jié)構(gòu)去年發(fā)表晚了,尚未放在數(shù)據(jù)庫(kù)里被AlphaFold用來(lái)訓(xùn)練,所以它預(yù)測(cè)的模型就與實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu)嚴(yán)重不符。

編輯 舉報(bào) 2023-04-27 12:45

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